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糖组学是继基因组学和蛋白质组学后生命科学的新兴研究领域.其主要研究内容为:寡糖的空间结构及其在生物机体中所发挥的功能.寡糖作为一种重要的碳水化合物,参与蛋白质折叠和信号转导等多种细胞生命过程,同时,它经常与蛋白质和脂类化合物结合在一起形成糖蛋白和糖脂.

寡糖通常由多个单糖通过糖苷键连接而成,并呈现出树形的分枝结构.因此,寡糖结构的解析是一个包括对糖类分子组成、单糖的连接顺序和连接位点依 次逐层解 的过 程. 1 示出了 N GlcNAc2Man9 结构的多种经典表示方式,虽然表示方式不同,但它们都是以树形结构呈现,每一树形结构根节点位于结构的最右边,子节点向左逐步延伸,每一个节点代表一个单糖,每一条边代表连接 2 个单糖的糖

苷键,数字代表寡糖结构中单糖之间的连接位点,琢、茁 是指通过半缩醛形成六元环的结构时羟基的相对位置.寡糖的树形结构增加了寡糖结构的解析难度.图 2 示出了寡糖结构中 2 个单糖之间通过糖苷键连接的表示方式,每一个单糖通过糖苷键可以跟另外一个或多个单糖相连接形成如同树形的分枝结构,这种分枝结构的复杂性导致了寡糖结构的多样性。

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广靶靶向寡糖组学分析包括糖组学实验及糖组学数据分析两大部分,其中数据分析主要包括差异寡糖物质筛选及寡糖结构解析。基于实验设计、样本的采集及处理、寡糖物质提取以及寡糖物质的检测分析获取寡糖组学的数据,可以进行寡糖物质的鉴定与样本数据的质控分析,并筛选出一些有差异的寡糖物质,从而对样本的寡糖物质进行相关的功能预测和分析。 本项目基于UPLC LTQ-

Orbitrap MS/MS velos平台,对寡糖样本阳离子模式下的质谱数据,进行寡糖组学定性定量分析。

博睿糖寡糖库(BRT-carbohydrate libary),经过8年积累,寡糖数据库约900多种,打谱构建的寡糖库,覆盖大量植物寡糖类,如半乳寡糖,甘露寡糖,葡甘露寡糖,半乳甘露寡糖,阿拉伯寡糖,木寡糖,阿拉伯木寡糖,支链淀粉寡糖,直链淀粉寡糖,木葡寡糖。

实验流程


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实验结果有三部分组成:第一 定性表,第二是定量表,第三是原始数据。如果做寡糖指纹图谱的话,也有对应的对比的报告。

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 参考文献:串联质谱寡糖结构解析方法评介。


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